Todavía no está definido quién ocupará la subsecretaría, cargo clave para que Bayardi acepte ser el ministro.
José Bayardi ya tiene experiencia en el Ministerio de Defensa. En 2005 cuando Tabaré Vázquez asumió la Presidencia, fue designado como subsecretario de esa cartera y tras el retiro por razones de salud de Azucena Berruti quedó como titular del Ministerio, cargo que desempeñó entre febrero de 2008 y agosto de 2009.
En ese período como ministro de Defensa, lo acompañó como subsecretario Jorge Menéndez. Durante el gobierno de Mujica en 2013 se convirtió en ministro de Trabajo en sustitución de Eduardo Brenta.
Como integrante de la comisión de Defensa de la Cámara de Diputados fue un activo articulador de la negociación con la oposición para aprobar la llamada ley de inteligencia que define y regula el sistema de inteligencia del Estado, promulgada en 2018.
Es dirigente de la Vertiente Artiguista y por ese sector había asumido por primera vez como diputado en 1990. Actualmente preside la comisión de relaciones internacionales del Frente Amplio.
